Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Stra6O70491 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stra6O70491 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Stra6O70491 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Stra6O70491 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stra6O70491 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stra6O70491 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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