Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb2O55203 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ldb2O55203 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb2O55203 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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