Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DffaO54786 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DffaO54786 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DffaO54786 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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