Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CrxO54751 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms