Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms