Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms