Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk2O35491 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk2O35491 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk2O35491 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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