Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt1O35449 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms