Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Foxd2O35392 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Foxd2O35392 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms