Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hps1O08983 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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