Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Flot1O08917 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Flot1O08917 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms