Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ube3aO08759 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube3aO08759 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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