Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Efna3O08545 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Efna3O08545 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Efna3O08545 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Efna3O08545 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms