Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc191J3QQ27 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc191J3QQ27 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms