Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms