Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccer2J3QPU5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms