Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm2035J3QP87 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms