Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20795J3QP49 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms