Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc180J3QNE4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms