Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm20828J3KMI7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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