Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms