Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Arfgef1G3X9K3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms