Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9yF8VPU6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms