Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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