Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17093F6XGJ4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms