Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms