Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Urb2E9Q7L1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms