Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddx60E9PZQ1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ddx60E9PZQ1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddx60E9PZQ1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms