Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms