Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rfx8D3YU81 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rfx8D3YU81 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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