Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm20547B8JJN0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20547B8JJN0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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