Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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