Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms