Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Top3bQ9Z321 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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