Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms