Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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