Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Uso1Q9Z1Z0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms