Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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CnmdQ9Z1F6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CnmdQ9Z1F6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms