Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn9Q9Z0S7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms