Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamc3Q9R0B6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms