Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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