Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Col4a4Q9QZR9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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