Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc4Q9QZD4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms