Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VapbQ9QY76 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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