Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpsf3Q9QXK7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms