Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolkQ9QUG2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms