Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms