Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms