Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1aQ9JLR9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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