Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scube2Q9JJS0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms